V roce 1993 se na obálce časopisu Wired objevili tři maskovaní muži. Eric Hughes, matematik z Kalifornské univerzity v Berkeley, Timothy May, bývalý vedoucí vědec společnosti Intel, a John Gilmore, počítačový vědec a spoluzakladatel Electronic Frontier Foundation, byli známí jako cypherpunkové. Článek Stevena Levyho s názvem „Crypto Rebels“ v časopise byl první zmínkou o těchto lidech v médiích.

Koncem roku 1992 tito tři muži pozvali 20 svých přátel na neformální setkání, aby prodiskutovali důležité otázky v programování a kryptografii. Tato setkání se stala měsíční a konala se v Cygnus Solutions Johna Gilmora. Na jednom z prvních setkání byla skupina nazvána „cypherpunks“, což byla slovní hříčka mezi „šifrou“ a „kyberpunkem“.

Skupina rostla a bylo rozhodnuto vytvořit seznam adresátů, aby přilákali další cypherpunks mimo San Francisco. Seznam adresátů se stal populární a zahrnoval stovky účastníků, kteří si vyměňovali nápady a diskutovali o vývoji pomocí nových metod šifrování, jako je PGP. Díky tomu se myšlenky rozšířily po celém světě.

Skupina diskutovala o široké škále témat, včetně matematiky, kryptografie, informatiky, politiky a filozofie. Přestože skupina nebyla vždy jednotná, jednalo se o otevřené fórum, kde se cenilo soukromí a osobní svobody.

Hlavní myšlenky cypherpunks byly nastíněny v „Cypherpunk Manifesto“, který napsal Eric Hughes v roce 1993. Jednou z klíčových zásad manifestu byla důležitost důvěrnosti. Manifest také obsahoval myšlenky, které byly později implementovány do kryptoměn.

V následujících letech bylo učiněno několik pokusů o vytvoření anonymních transakčních systémů. V roce 1997 vytvořil Dr. Adam Back systém Hashcash, který chránil před spamem a vyžadoval výpočetní výkon pro odesílání e-mailů. V roce 1998 Wei Dai publikoval B-Money, nabízející metody pro ukládání transakčních dat. V roce 2004 vytvořil Hal Finney opakovaně použitelné důkazy o práci a v roce 2005 Nick Szabo představil projekt Bitgold.

Skutečný průlom však přišel v říjnu 2008, kdy Satoshi Nakamoto poslal svůj článek do cypherpunkové konference. V tomto článku se podíval na problémy, s nimiž se vývojáři již dříve setkali, a navrhl řešení, včetně dvojího utrácení. V lednu 2009 Nakamoto vytěžil genezi blok bitcoinu a to znamenalo začátek éry kryptoměn.